采用 AccuGENX-ID® ProSeq 进行蛋白质编码基因测序

偶尔,有一些 生物的亲缘关系太近,并且在核糖体 RNA 区具有高度保守性,以至于 16S 测序无法将它们分开(我们的“物种*”置信水平,表示未知与两个或更多密切相关的物种相匹配)。

网络研讨会:洋葱伯克霍尔德菌复合体
在医药行业

洋葱伯克霍尔德氏菌,我们的细菌鉴定服务可用该生物体帮助确定物种水平了解因洋葱伯克氏菌污染导致的产品召回历史和可用的细菌鉴定服务,以确定该生物体的物种水平。

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利用 AccuGENX-ID® ProSeq 的细菌鉴定服务是一种高度区分的精确序列鉴定方法,可用于在物种层面区分密切相关的微生物。通过分析蛋白质编码基因实现区分。

如果 AccuGENX-ID® 报告包含物种*置信水平(表示鉴定分辨率达到群组或复合体水平),并且我们已经确定可以区分生物群组不同物种的目标基因,客户可以要求我们使用 ProSeq 服务进行鉴定。

符合条件的细菌物种包括洋葱伯克霍尔德菌复合体 (BCC) 等。请联系我们获取可用于密切相关微生物群组物种鉴定的完整清单。

  • 产品规格

    订单代码

    周转时间 (TAT) 检测代码
    1 天 PROSEQ-1
    5 天 PROSEQ-5

利用 AccuGENX-ID® BacSeq 提供细菌鉴定服务

对于许多生物,传统的表型鉴定并不可靠,要花费大量时间并且可能导致细菌鉴定结果的解释具有主观性。 并非给定细菌物种的所有菌株始终表现出特定的特征,从而限制了表型鉴定方法。另外,用于支持表型鉴定的数据库很有限。

我们的 AccuGENX-ID® BacSeq 细菌鉴定服务过程遵循分类学家使用的参考方法,因为它为鉴定提供最准确、最可靠的序列数据。如果将此流程与范围全面、经过验证的 Accugenix® 库相结合,由此得出的系统发育分析是独一无二的。

AccuGENX-ID® 鉴定报告指南

此处为 Alt 文本下载我们的指南以解释由 AccuGENX-ID® 生成的细菌鉴定结果。

下载指南

Charles River AccuGENX-ID® BacSeq 通过对细菌 16S 核糖体 RNA (rRNA) 基因进行比较测序来鉴定微生物。对细菌 DNA 序列进行质量评估、组装,并与经验证的 Accugenix®进行比较。系统发育树由训练有素的数据分析人员解释,以进行细菌检定和鉴定。

我们的微生物系统发育学家在解释细菌鉴定报告和分配分类置信水平时,结合使用遗传变异性、相邻连接树的分支顺序和种间变异的知识。

Charles River 细菌鉴定服务采用的专有方法将样品序列与范围全面的专有库进行比较,得出结论性数据解释,并根据系统发育分析指定的置信度进行鉴定。

利用这种经过科学验证的方法和我们经验证的、持续管理的、专有的细菌库,可提供最准确的细菌鉴定。 将细菌鉴定外包给我们符合 cGMP、ISO 17025 认可的合同检测实验室,有助于为其他重要的质控任务节省时间和资源。

  • 产品规格

    订单代码

    周转时间 (TAT) 检测代码
    当天 BacSeq-0
    1 天 BacSeq-1
    2 天 BacSeq-2
    5 天 BacSeq-5


细菌鉴定服务常见问题 (FAQ)

  • 用什么技术来鉴定细菌?

    16s rRNA 测序被称为细菌鉴定的黄金标准。对细菌 16S 核糖体 RNA (rRNA) 基因进行对比性测序,此类基因型方法被业界公认为是最准确且可重现的未知微生物鉴定方法。该技术具有内在稳定性,能确保提供用于鉴定的可重现数据。另一种适合细菌鉴定的鉴定方法是基质辅助激光解吸/电离飞行时间 (MALDI-TOF) 质谱法。MALDI-TOF 检测过程产生独特的蛋白质光谱指纹,可以与细菌数据库进行比较以进行鉴定。多种表型鉴定方法也可用于细菌鉴定,但这些生化和代谢试验本质上较为主观,无法提供足够的鉴别,以提供准确和可重现的鉴定结果。我们的细菌鉴定服务提供 16s rRNA 测序和 MALDI-TOF 选项,因为它们是最可靠的方法。

  • 为什么准确的细菌鉴定很重要?

    准确的细菌鉴定对于制药和其他受监管产品生产行业的环境监测 (EM) 计划至关重要。鉴定未知菌株是了解微生物对生产环境、最终产品以及随后对患者的风险必不可少的第一步。准确细菌鉴定服务提供 EM 数据跟踪和趋势分析解决方案,有助于维护设施微生物菌群的清晰基线视图,以便及早识别异常活动,并有时间进行补救。

  • 准确细菌鉴定的关键要素是什么?

    生物参考库是细菌鉴定过程的重要组成部分。如果数据库中没有匹配的物种条目,则无法准确鉴定细菌分离物。因此,相关且经验证的参考库与用于鉴别细菌的技术和方法同样重要。除了库比较之外,序列的解释和报告的生成也是细菌鉴定过程的关键部分。

  • 哪些微生物样品需要鉴定?

    任何在环境监测检测、生物负荷测试或无菌测试中检测到的分离物都应提交鉴定。